brewのMySQLを再インストール

プロセスをチェックして切る

$ ps -ax | grep mysql
$ kill <process_id>

brewから削除
バージョン指定してインストールしている場合は、@の後にバージョン追記する

$ brew remove mysql@5.6
$ brew cleanup

設定ファイル等を消す

sudo rm -rf /usr/local/var/mysql
...

バージョン指定してインストール
必要に応じてパスも通す

$ brew install mysql@5.6